بعد از یک سری آزمایشات علمی که منجر به وجود بدل " میوتو " میشود و این موجود قصد به نابودی دنیا دارد , اش و دوستانش سعی دارند از این واقعه جلوگیری کنند .

" اش کتمن ساکن "شهر پالت " امروز ده ساله شده و این بدان معنیست که میتواند یک آموزشیار پوکمون شود و ماجراجوئی های زیادی در پیش دارد

هنگامی که خاکستر ، پیکاچو و دوستانشان از یک شهر کویری در کنار دریا بازدید می کنند ، با Mypical Pokémon Hoopa ملاقات می کنند ، که توانایی احضار اشیا-- از جمله افراد و Pokémon - را از طریق حلقه جادویی خود دارد. پس از یک حادثه ترسناک ، آنها یاد می گیرند...

آرسیوس، خالق جهان، به خاطر دزدی جواهر زندگی درباره بشریت قضاوت می‌کند، اما اش کچام و دوستانش در زمان به عقب فرستاده می‌شوند تا وقایعی را که منجر به انتقام‌جویی آرسیوس شده است، کشف کنند و ممکن است معکوس کنند.

وقتی پوکمون جدیدی که توانایی ساختن جهان موازی را دارد ظاهر می‎شود، اش و دوستانش وظیفه دارند یک غریبه را که قصد دارد از قدرت‎های پوکمون سوء استفاده کند متوقف سازند...

زمانی که دو پوکمون قدرتمند، دیالگا و پالکیا، از مسیرها عبور می‌کنند و می‌جنگند و ابعاد زمان و مکان را مخدوش می‌کنند، یک شهر ایده‌آل در هرج و مرج فرو می‌رود. تنها امید از Darkrai می آید، یک پوکمون سایه ای که مردم شهر از آن دوری می کنند.

دو دزد کنترل یک سلاح باستانی را به دست می گیرند که برای دفاع از شهر کانال آلتومار طراحی شده است.

"کنیشی" و عمویش "شانسوکه" تلاش می کنند تا از اسرار دختر رباتی "تامارا" با خبر شوند...

Ash باید شکارچی را که پوکمون سلبی افسانه ای را مجبور می کند تا به او کمک کند تا یک جنگل را نابود کند، متوقف کند.